The Hundred Line : Last Defense Academy : Kodaka met l'emphase sur l'importance des choix dans le jeu

Que l'on soit clair: par le passé, les choix présentés dans les jeux Danganronpa (ou même dans la série des Zero Escape) n'avaient en réalité que peu d'importance, puisqu'un script unique était suivi par le joueur quels que soient ses choix. Pour The Hundred Line: Last Defense Academy, les décisions du joueur devraient avoir un impact bien plus important.